前列腺腺癌 (PRAD) 是男性死亡的主要原因。mRNA疫苗提供了一种获得满意结果的有吸引力的方法；然而，肿瘤抗原筛选和疫苗接种候选者在该领域显示出瓶颈。该研究旨在探索用于 mRNA 疫苗开发的肿瘤抗原和免疫亚型，以选择合适的疫苗接种患者。

2021年12月6日，四川大学艾建忠团队在Molecular Cancer （IF=27）在线发表题为“Tumor-antigens and immune landscapes identification for prostate adenocarcinoma mRNA vaccine”的研究论文，该研究鉴定了 8 种对 PRAD 预后价值较差的过度表达和突变的肿瘤抗原，包括 KLHL17、CPT1B、IQGAP3、LIME1、YJEFN3、KIAA1529、MSH5 和 CELSR3。该研究评估了这些基因与抗原呈递免疫细胞的相关性。该研究进一步确定了具有不同临床、分子和细胞特征的三种 PRAD 免疫亚型（PRAD 免疫亚型 [PIS] 1-3）。 

PIS1 显示出更好的存活率和免疫细胞浸润，然而，PIS2 和 PIS3 显示出“冷”肿瘤特征，预后较差，肿瘤基因组不稳定性更高。此外，这些免疫亚型与免疫检查点、免疫原性细胞死亡调节剂和 PRAD 的预后因素有显著关联。此外，免疫景观表征揭示了 PRAD 患者的免疫异质性。总之，该研究表明 KLHL17、CPT1B、IQGAP3、LIME1、YJEFN3、KIAA1529、MSH5 和 CELSR3 是 PRAD mRNA 疫苗开发的潜在抗原，而 PIS2 和 PIS3 组的患者更适合接种疫苗。

另外，2021年12月6日，四川大学艾建忠团队在Molecular Cancer （IF=27）在线发表题为“Tumor antigens and immune subtypes guided mRNA vaccine development for kidney renal clear cell carcinoma”的研究论文，该研究通过在 TCGA-KIRC 数据集中进行表达、突变、存活和相关性分析，确定了四个基因，包括 DNA 拓扑异构酶 II α (TOP2A)、中性粒细胞胞质溶胶因子 4 (NCF4)、formin样蛋白 1 (FMNL1) 和对接蛋白 3 ( DOK3) 作为潜在的肾透明细胞癌 (KIRC) 特异性新抗原候选者。这四个基因在 TCGA-KIRC 中上调、突变并与存活和抗原呈递细胞呈正相关。此外，该研究确定了 KIRC 的两种免疫亚型，称为肾细胞癌免疫亚型 1 (RIS1) 和 RIS2。在 RIS1 和 RIS2 之间观察到不同的临床、分子和免疫相关特征。RIS2 患者的生存结果优于 RIS1 患者。进一步全面的免疫相关分析表明，RIS1 在免疫学上是“热”的，代表一种免疫抑制表型，而 RIS2 则代表一种免疫学上的“冷”表型。RIS1 和 RIS2 在肿瘤浸润免疫细胞和免疫检查点相关基因方面也表现出不同的特征。此外，免疫景观构建识别了每个 KIRC 患者的免疫细胞成分，预测了他们的生存结果，并协助开发了个性化的 mRNA 疫苗。总之，该研究将 TOP2A、NCF4、FMNL1 和 DOK3 确定为 KIRC mRNA 疫苗开发的潜在有效新抗原，RIS2 肿瘤患者可能从 mRNA 疫苗接种中获益更多。

鉴定用于 mRNA 疫苗开发的潜在 PRAD 特异性抗原（图源自Molecular Cancer ）